近日,我所生物技术研究部生物分子功能研究组(1833组)朴海龙研究员团队基于生物信息学方法,揭示了癌症中关键的去泛素化与泛素化分子相互作用网络。
去泛素化与泛素化作用是生命体内至关重要的转录后修饰作用,参与到细胞周期、免疫调控、信号传递等几乎所有的生物学通路过程中。同时,该作用体系对于癌症的发生和发展也发挥重要作用。其中,去泛素化与泛素化作用分别依赖于去泛素化酶及E3泛素连接酶实现对底物的特异性识别。然而,无论是去泛素化酶还是E3泛素连接酶,其蛋白种类多样,并且与底物之间呈现“多对多”的复杂相互作用关系。目前,尚有很多“去泛素化酶-底物”相互作用及“E3泛素链接-底物”相互作用未被揭示。
该团队通过对生物分子结构信息、蛋白质组学表达谱、基因组表达谱、分子网络等生物大数据资源的深入挖掘,分别构建了针对“去泛素化酶-底物”及“E3泛素连接酶-底物”相互作用的预测模型,实现对潜在未知底物的识别,并结合分子生物学实验对计算结果进行了验证。同时,在对“去泛素化酶-底物”相互作用的研究中,进一步融合癌症多组学数据资源,揭示了多种癌症中具有癌症特异性功能的“去泛素化酶-底物”相互作用。相关研究结果将为泛素化、去泛素化作用体系的研究提供有利参考,同时促进发现靶向泛素化、去泛素化作用体系的新型癌症治疗靶标。
两项工作得到国家自然科学基金、博士后基金、我所创新基金的资助,并于近日分别发表于Oncogene及iScience杂志上。同时,这两项工作也是献礼我所七十周年所庆文章。(文/图 陈迪)